校本课程是新课程的重要组成部分，它与国家课程、地方课程相对应，是推进素质教育的一项具体措施。随着新课程进入深化时期，为了更好地推进课程改革，付窝小学根据本校的实际情况，大力开发实施校本课程，发展学生个性特长。
付窝小学的校本课程以学生需要为指向，以教师自主为操作手段，以学校特色发展为个性平台。教师自主探究、开发的校本课程主要有以下几大类：1、文化艺术类课程：朗诵、电脑绘图、舞蹈、乐器、美术等等。2、生活技能实践类课程：手工制作、剪纸、植物栽培等等。3、体育技能类课程：武术、体操、田径、球类等等。4、科技发明类课程：航模、电脑网络、天文地理观测等等。学校45周岁以下的教师都根据自己的特长开设一门校本课程，每周五下午的最后一节课为全校统一的校本课程上课时间。每到上校本课程的时间，学生们都兴致勃勃、积极主动地参与到自己所报的班中。张丽老师的剪纸课，带领一帮心灵手巧的孩子剪出了美好的生活；刘涛老师的朗诵课，让学生在快乐中锻炼了口才；杨新胜老师的武术课，让学生强健了体魄，学会了健身与防身；单连香老师的地理观测课，让学生认识了伟大的祖国，了解了多彩的世界……付窝小学的校本课程不但发展了学生的特长与兴趣，也受到了家长与社会的好评。
